Die Museen in Ljubljana und der Umgebung bewahren eine Reihe von wichtigen prähistorischen Funden. Neben der schon erwähnten Flöte aus Divje Babe, können Sie im Nationalmuseum Sloweniens auch die Überreste der alten Kultur der Pfahlbauer aus dem Ljubljana Moor-Gebiet besichtigen. Darunter befindet sich auch das älteste Rad aus Holz der Welt mit einer Achse, das vom Stadtmuseum von Ljubljana aufbewahrt wird und gelegentlich dort ausgestellt wird.
Der Ausstellungsplatz Moja Ljubljanica in Vrhnika bietet eine Sammlung von archäologischen Funden aus dem Fluss Ljubljanica an, die neben dem Nachlass der Pfahlbauer auch Überreste aus der Römerzeit umfasst. Das Erbe der römischen Stadt Emona wurde zum Teil in Ljubljana aufbewahrt und steht zur Schau in drei archäologischen Freilichtparks.
Die Ausstellung Slovenska Zgodovina (die slowenische Geschichte) auf der Burg von Ljubljana, bietet einen schnellen Überblick über spätere Epochen. Im Detail und aus verschiedenen Blickwinkeln können Sie die Geschichte von Ljubljana im Slowenischen Nationalmuseum, im Stadtmuseum von Ljubljana, im Slowenischen Ethnographischen Museum und im Museum der Neueren Geschichte erkunden.
Bewundernswerte Sammlungen von technischem Erbe sind im Technischen Museum Sloweniens in Bistra bei Vrhnika und im Eisenbahnmuseum ausgestellt.