Thematisch ist die Wasserstadt Atlantis in drei Bereiche gegliedert, die für Besucher verschiedener Altersgruppen bestimmt sind. Die Anlage hat 16 Badebecken (6 große Becken, 4 Kinderbecken und 6 Spezialbecken) mit insgesamt ca. 1.800 Quadratmetern Wasserflächen. Der Komplex, dessen überdachter Teil rund 15.000 Quadratmeter umfasst, und kann 1.600 Besucher auf einmal aufnehmen.
Der erste Bereich, der "Thermaltempel", ist für etwas ältere Besucher bestimmt und umfasst Thermalbecken, Kaskadenbäder und drei Badebecken mit Massagebänken. Der zweite Bereich, die "Erlebniswelt", bietet neben Badebecken auch zahlreiche Wasserattraktionen, darunter einen 150 bis 200 Meter langen schnellen Fluss, Karsthöhlen, durch man unter Wasser durchschwimmen kann, ein Wellenbecken mit Atoll und zwei große Wasserrutschbahnen.
Der dritte Bereich, die "Saunenwelt", umfasst verschiedene Saunen. Der im Freien befindliche Teil bietet folgende Saunen: Aufguss-, Bio-, Stein- und Erdsauna. Im Innenbereich erwartet Sie unter anderem auch ein heißes Bad in einer unterirdischen Höhle.
Neben dem sonstigen Angebot werden in der Wasserstadt auch thematische Partys, Sommersportspiele, Wettbewerbe, thematische Wochen u. a. m. veranstaltet. Außerdem können Geburtstags- und Jubiläumsfeiern organisiert werden.