Biotehniška fakulteta ima svoj sedež v Biotehniškem središču, le nekaj minut vožnje od središča mesta in obvoznice na severozahodu Ljubljane. Ima lastno parkirišče, dostopna pa je tudi z javnim prevozom.
Fakulteta je organizirana v sedmih oddelkih, ki delujejo v petih različnih stavbah. Štiri od njih so v Ljubljani, ena pa 15 km stran, v bližini Domžal.
Največja med zmogljivostmi, ki jih je mogoče uporabiti za srečanja, se nahaja na Jamnikarjevi ulici 101. Nedaleč stran, dosegljive peš iz študentskega naselja, v bližini živalskega vrta in gozdnatega pobočja Rožnika, so še stavbe Oddelka za biologijo, Oddelka za Gozdarstvo in Oddelka za lesarstvo. Vse predavalnice so opremljene z računalniki in LCD projektorji.